Характеристика кишечной микробиоты у пациентов с врожденной кишечной атрезией: предварительное исследование формирования и влияния начальной кишечной флоры у новорожденных

Введение

Исследование посвящено анализу различий в микробном составе между проксимальными и дистальными отделами кишечника у новорожденных с кишечной атрезией. Цель работы — изучить механизмы формирования начальной кишечной микробиоты у новорожденных, а также проанализировать влияние дифференциальных метаболических путей на организм беременных и плода.

Цель

Изучить различия в составе микробиоты между проксимальным и дистальным отделами кишечника у новорожденных с кишечной атрезией, а также оценить потенциальное влияние дифференциальных метаболических путей на состояние беременных и плода.

Методы

Для анализа микробного состава использовали секвенирование 16S рРНК. Рассчитывали альфа- и бета-разнообразие для сравнения состава микробиоты между тремя группами. Различия в микробных сообществах оценивали с помощью анализа главных координат (PCoA). Функциональное влияние дифференциальных метаболических путей предсказывали с помощью программного обеспечения PICRUSt, сравнивая данные с публичными базами данных.

Результаты

В исследование включили 23 новорожденных с кишечной атрезией (образцы проксимального и дистального отделов кишечника) и 25 здоровых новорожденных (первородный меконий). Статистически значимых различий в базовых характеристиках между группами не выявлено (P > 0,05).

• Анализ альфа-разнообразия показал, что дистальный отдел кишечника обладает большим видовым богатством микробиоты.
• Бета-разнообразие выявило значимые различия в бактериальном составе между контрольной группой и дистальным отделом кишечника (P < 0,05).
• Функциональный анализ показал, что дифференциальные метаболические пути могут оказывать защитное действие на кишечный барьер, но негативно влиять на регуляцию уровня глюкозы и транспорт липидов у беременных и плода, а также способствовать развитию неблагоприятных эмоциональных состояний у беременных.

Выводы

Различия в микробном профиле между группами позволяют предположить, что формирование кишечной микробиоты у новорожденных происходит под влиянием как плацентарной передачи, так и колонизации пищеварительного тракта. Метаболические различия могут оказывать плейотропные эффекты, включая защиту кишечного барьера, но также потенциально негативное влияние на эмоциональное состояние и метаболизм глюкозы и липидов.

Термины и сокращения

• 16S рРНК — генетический маркер, используемый для идентификации бактерий.
• PCoA (Principal Coordinates Analysis) — метод статистического анализа, позволяющий визуализировать различия между образцами.
• PICRUSt — программное обеспечение для предсказания функционального потенциала микробных сообществ.
• Альфа-разнообразие — мера видового богатства внутри одного образца.
• Бета-разнообразие — мера различий в составе микробиоты между образцами.